मोटापा सर्जरी के लिए रोगियों के चयन के लिए दिशा निर्देश राष्ट्रीय स्वास्थ्य संस्थान द्वारा स्थापित किए गए थे:

1.    मरीजों को आदर्श शरीर के वज़न से लगभग 100 पाउंड (45.5 किलो) ज्यादा या आदर्शों शरीर के वजन से 100% अधिक होना चाहिए।
2.    मरीजों को कोई ज्ञात चयापचय (भोजन का ऊर्जा में रासायनिक परिवर्तन) या अंत: स्रावी (हार्मोन) रुग्ण मोटापे के लिए होनी चाहिए।
3.    मरीजों को एक निष्पक्ष दर्जे की जटिलता (शारीरिक, मानसिक, सामाजिक, या आर्थिक) होनी चाहिए जिसमे वजन कम करने से लाभ हो सकता है। इसमें उच्च रक्तचाप (हाई ब्लड प्रेशर), मधुमेह (रक्त में बहुत अधिक मिठास), हृदय रोग, सांस लेने में समस्या या फेफड़ों के रोग, स्लीप एपनिया (खर्राटों) और गठिया भी शामिल हैं।
4.    रोगी को संदिग्ध खतरों और मुश्किलों सहित प्रस्तावित शल्य चिकित्सा की प्रक्रिया के पूरे महत्व को समझना चाहिए।
5.    मरीज को कई वर्षों के लिए एक चिकित्सा पेशेवर द्वारा जांच के लिए मानना चाहिए।
6.    रोगी द्वारा वजन कम करने का असफलतापूर्वक चिकित्सा उपचार उपयोग कर प्रयास किया जाना चाहिए।
कुछ मामलों में, एक मरीज जिसका भार 100 पौंड नहीं है या आदर्श शरीर के वजन से 100% ऊपर  नहीं है, वह शल्य चिकित्सा हस्तक्षेप के लिए एक उम्मीदवार है। इस मरीज को महत्वपूर्ण चिकित्सा समस्या होनी चाहिए जिनका वजन कम करने से फायदा हो सकता है।